Profile | |
Accession Number | AK663 |
Filename | Kelch_D_c.prf |
Author | |
Theme | Beta-propeller |
Category | Repeats |
Validated | Yes |
Description | Kelch 6-blade B-propeller Circular |
Full profile | ID Kelch B-propeller; MATRIX. AC AK663; DT 13/08/2019 DE Generated from MSF file: '/home/mllanos/profiles/Bpropeller/Kelch_6/aligns/Kelch_D_w.msf'. MA /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=48; TOPOLOGY=CIRCULAR; MA /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=44; CC Automatic scaling using reversed database MA /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.2053; R2=0.00866637; TEXT='NScore'; MA /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=726; N_SCORE=8.5; MODE=1; MA /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=495; N_SCORE=6.5; MODE=1; MA /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=*; B1=*; E0=*; E1=*; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; MA /I: B0=0; B1=0; E0=0; E1=0; BI=-105; BD=-105; IE=-105; DE=-105; MA /M: SY='G'; M=9,-7,-21,-10,-14,-23,32,-18,-25,-15,-23,-16,1,-17,-14,-17,10,-2,-15,-25,-24,-14; MA /M: SY='V'; M=0,-23,-8,-26,-23,-3,-17,-22,12,-21,8,9,-20,-25,-20,-20,-9,-4,17,-26,-10,-22; MA /M: SY='A'; M=22,-14,-4,-21,-15,-16,-4,-22,-5,-15,-8,-7,-12,-17,-15,-20,2,-1,5,-25,-18,-16; MA /M: SY='V'; M=2,-16,-16,-19,-15,-6,-21,-19,9,-15,-3,-1,-13,-16,-14,-16,0,2,16,-26,-9,-15; MA /M: SY='V'; M=-9,-9,-20,-7,-13,-9,-25,-6,5,-13,3,3,-13,-22,-14,-13,-11,-5,12,-27,-4,-15; MA /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32; MA /M: SY='G'; M=-5,11,-26,9,3,-29,15,-1,-29,-3,-27,-17,15,-15,5,-6,4,-10,-28,-28,-20,4; MA /M: SY='G'; M=-9,16,-28,18,-1,-30,25,-6,-35,-6,-29,-22,18,-17,-7,-5,1,-12,-29,-30,-23,-5; MA /M: SY='H'; M=-12,-6,-21,-9,-3,-14,-21,9,-15,6,-7,1,-2,-19,3,7,-11,-8,-14,-23,-3,-1; MA /M: SY='I'; M=-7,-27,-20,-31,-25,2,-28,-24,27,-25,24,17,-24,-25,-21,-22,-18,-5,23,-23,-4,-24; MA /M: SY='Y'; M=-19,-24,-29,-27,-23,34,-28,5,0,-15,1,0,-23,-30,-17,-13,-22,-12,-7,36,59,-22; MA /M: SY='V'; M=13,-21,-8,-26,-21,-7,-20,-24,13,-19,5,3,-20,-22,-20,-21,-3,-1,22,-27,-13,-21; MA /M: SY='V'; M=-4,-28,-18,-32,-27,20,-23,-25,13,-23,8,4,-24,-28,-29,-21,-14,-7,21,-7,2,-27; MA /M: SY='G'; M=0,-9,-28,-10,-19,-23,52,-16,-32,-18,-23,-16,0,-21,-18,-18,-2,-17,-25,-18,-21,-19; MA /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20; MA /M: SY='F'; M=-12,-13,-23,-14,-5,9,-23,-6,-7,-6,-5,-4,-11,-20,-9,-2,-8,-6,-4,-12,9,-8; MA /M: SY='D'; M=-3,13,-22,14,-1,-16,-9,-3,-21,-5,-17,-15,8,-15,-6,-9,3,1,-16,-25,-6,-4; MA /I: I=-3; MI=-16; MD=-16; IM=-16; MA /M: SY='G'; M=-2,-1,-19,-2,-6,-19,10,-12,-21,-2,-17,-12,2,-13,-7,-3,3,0,-14,-21,-15,-7; D=-3; MA /I: I=-3; MI=0; MD=-16; IM=0; DM=-16; MA /M: SY='S'; M=-7,2,-17,2,0,-19,-9,-6,-19,0,-18,-12,1,-10,-1,-3,3,3,-13,-24,-9,-1; D=-3; MA /I: I=-3; MI=-16; MD=-16; IM=-16; DM=-16; MA /M: SY='T'; M=-1,-8,-13,-11,-7,-14,-14,-9,-10,-10,-5,-5,-7,-8,-3,-11,-2,2,-9,-24,-9,-6; D=-3; MA /I: I=-3; MI=-16; MD=-16; IM=-16; DM=-16; MA /M: SY='R'; M=-11,-11,-16,-11,-3,-13,-20,-8,-11,-4,-9,-6,-9,-6,-4,4,-9,-8,-10,-23,-9,-6; D=-3; MA /I: I=-3; MI=-16; IM=-16; DM=-16; MA /M: SY='L'; M=-8,-13,-20,-13,-11,-2,-17,-11,-3,-15,9,3,-12,-22,-10,-8,-8,-2,-2,-23,-5,-11; MA /M: SY='N'; M=-4,19,-21,15,6,-24,-8,-3,-24,6,-26,-18,22,-13,2,4,10,2,-21,-34,-17,4; MA /M: SY='S'; M=4,7,-18,7,2,-20,-10,-5,-20,-6,-20,-16,4,-11,-2,-8,14,10,-12,-30,-11,-1; MA /M: SY='V'; M=0,-29,-16,-31,-26,5,-27,-26,21,-23,17,9,-27,-27,-25,-21,-16,-5,28,-15,-4,-25; MA /M: SY='E'; M=-16,-3,-30,1,14,-2,-22,7,-20,-6,-12,-11,-7,-16,1,-7,-12,-13,-22,1,10,7; MA /M: M=-4,-14,-2,-17,-10,-10,-23,-14,-7,-4,-10,-5,-11,-21,-8,-3,-5,-3,-1,-22,-4,-10; MA /M: SY='Y'; M=-18,-23,-27,-25,-22,34,-30,6,4,-17,11,4,-22,-30,-16,-13,-22,-10,-5,17,57,-22; MA /M: SY='D'; M=-16,40,-19,43,10,-30,-8,3,-31,-1,-29,-25,32,-15,-1,-7,3,-6,-29,-38,-18,5; MA /M: SY='P'; M=-9,-20,-30,-20,-12,-7,-24,-19,0,-17,-5,-2,-17,29,-15,-19,-12,-6,-8,-24,-13,-16; MA /I: I=-5; MI=-27; MD=-27; IM=-27; MA /M: SY='E'; M=-3,2,-20,3,8,-21,-17,-10,-14,5,-15,-10,-1,-12,2,-1,2,2,-6,-28,-14,5; D=-5; MA /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27; MA /M: SY='T'; M=-1,7,-18,4,2,-20,-14,-11,-20,2,-19,-14,6,-11,-1,0,12,19,-12,-30,-14,0; MA /M: SY='N'; M=-8,15,-25,11,1,-23,1,-3,-24,2,-23,-16,20,-17,0,0,1,-7,-24,-24,-16,0; MA /M: SY='K'; M=-7,3,-26,4,17,-27,-18,-7,-25,21,-22,-12,1,-9,12,14,1,1,-19,-25,-13,14; MA /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20; MA /M: SY='T'; M=-3,-2,-18,-8,-5,-11,-16,-7,-12,-2,-15,-9,3,-15,-5,0,9,11,-5,-28,-10,-6; MA /I: I=-6; MI=-32; MD=-32; IM=-32; MA /M: SY='E'; M=-6,-6,-26,-5,5,-18,-17,-4,-12,1,-12,-5,-6,-8,5,-3,-5,-7,-12,-22,-9,4; D=-6; MA /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32; MA /M: SY='V'; M=-5,-27,-8,-30,-24,5,-29,-22,19,-24,19,12,-25,-28,-22,-21,-16,-5,21,-23,-3,-24; MA /I: I=-3; MI=-17; MD=-17; IM=-17; MA /M: SY='P'; M=1,-1,-13,-2,2,-12,-7,-4,-6,-3,-9,-4,2,5,1,-6,1,-2,-8,-16,-10,0; D=-3; MA /I: I=-3; MI=-17; MD=-17; IM=-17; DM=-17; MA /M: SY='A'; M=15,-3,-11,-7,-5,-14,-4,-8,-11,-5,-11,-8,-2,-9,-6,-9,8,8,-4,-19,-11,-6; D=-3; MA /I: I=-3; MI=-17; MD=-17; IM=-17; DM=-17; MA /M: SY='P'; M=-4,-6,-26,-3,5,-25,-12,-9,-21,-6,-23,-17,-5,35,-4,-11,-2,-4,-23,-28,-22,-3; D=-3; MA /I: I=-3; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17; MA /M: SY='P'; M=-6,-17,-23,-19,-12,-4,-14,-12,-1,-13,1,10,-16,13,-10,-14,-12,-6,-7,-18,-9,-12; D=-3; MA /I: I=-3; MI=-17; MD=-17; IM=-17; DM=-17; MA /M: SY='P'; M=-5,3,-21,3,4,-19,-10,-4,-18,-1,-19,-14,5,6,-1,-3,6,3,-17,-27,-15,1; D=-3; MA /I: I=-3; MI=-17; MD=-17; IM=-17; DM=-17; MA /M: SY='T'; M=-1,-8,-19,-10,-8,-14,-9,-11,-8,-9,-9,-3,-7,-10,-6,-11,2,5,-3,-24,-10,-8; D=-3; MA /I: I=-3; MI=-17; MD=-17; IM=-17; DM=-17; MA /M: SY='R'; M=-4,-8,-20,-7,-1,-21,-3,-10,-21,3,-20,-13,-3,4,-2,8,0,-5,-17,-22,-17,-4; D=-3; MA /I: I=-3; MI=-17; IM=-17; DM=-17; MA /M: SY='R'; M=-16,-14,-16,-15,-7,-16,-22,-5,-20,17,-13,-2,-6,-22,2,47,-11,-9,-10,-23,-11,-6; MA /M: SY='S'; M=4,-6,-11,-7,-7,-14,-5,-12,-13,-12,-11,-10,-1,-17,-8,-12,11,3,-8,-30,-13,-8; MA /M: SY='G'; M=-3,-12,-27,-14,-16,-19,26,-14,-23,-15,-18,-11,-6,-20,-11,-13,-4,-12,-18,-7,-14,-14; MA /M: SY='V'; M=3,-17,-19,-22,-18,1,-12,-2,-1,-19,-1,0,-12,-21,-17,-17,-6,-7,4,-20,-2,-18; CC /GENERATED_BY="pfmake -1 -c /home/mllanos/profiles/Bpropeller/Kelch_6/aligns/Kelch_D_w.msf blosum45.cmp"; // |