Profile | |
Accession Number | AK665 |
Filename | Lectine_5_c.prf |
Author | |
Theme | Beta-propeller |
Category | Repeats |
Validated | Yes |
Description | Lectine 5-blade Bpropeller Circular |
Full profile | ID Lectine_5 B-propeller; MATRIX. AC AK665; DT 13/08/2019 DE Generated from MSF file: '/home/mllanos/profiles/Bpropeller/Lectine_5/aligns/Lectine_5_w.msf'. MA /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=47; TOPOLOGY=CIRCULAR; MA /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=43; CC Automatic scaling using reversed database MA /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.7375; R2=0.01012097; TEXT='NScore'; MA /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=668; N_SCORE=8.5; MODE=1; MA /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=470; N_SCORE=6.5; MODE=1; MA /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=*; B1=*; E0=*; E1=*; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; MA /I: B0=0; B1=0; E0=0; E1=0; BI=-105; BD=-105; IE=-105; DE=-105; MA /M: SY='R'; M=-10,-1,-28,0,14,-27,-18,-4,-28,28,-25,-12,1,-11,15,29,-1,-6,-21,-24,-13,14; MA /M: SY='F'; M=-20,-21,-23,-29,-21,52,-27,14,-9,-24,1,0,-11,-27,-26,-14,-17,-13,-9,-1,27,-21; MA /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20; MA /M: SY='F'; M=-19,-30,-20,-39,-29,71,-30,-20,2,-30,15,2,-21,-30,-38,-20,-21,-10,1,6,26,-29; MA /M: SY='F'; M=-19,-30,-20,-39,-29,72,-30,-20,2,-30,14,2,-21,-30,-38,-20,-21,-10,1,7,27,-29; MA /M: SY='D'; M=-6,21,-20,24,5,-25,-8,4,-26,-5,-26,-20,18,-12,-1,-8,16,9,-19,-38,-15,2; MA /M: SY='P'; M=-5,-15,-32,-7,0,-27,-15,-17,-20,-10,-30,-20,-12,64,-7,-17,3,-2,-25,-33,-27,-7; MA /M: SY='N'; M=-11,22,-24,20,7,-25,-2,7,-24,-4,-24,-17,23,-16,-2,-6,2,-7,-22,-34,-17,2; MA /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20; MA /M: SY='Y'; M=-9,-5,-22,-7,-1,-8,-23,9,-13,0,-12,-6,-5,-16,-2,-3,-1,8,-9,-17,11,-4; MA /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20; MA /M: SY='Y'; M=-18,-21,-5,-24,-23,27,-30,8,-5,-15,-2,-3,-20,-32,-16,-14,-18,-10,-9,15,57,-23; MA /M: SY='G'; M=9,-10,-26,-12,-18,-28,57,-20,-34,-18,-26,-18,-2,-18,-18,-20,2,-16,-24,-20,-28,-18; MA /M: SY='V'; M=8,-27,-10,-28,-27,-3,-25,-28,24,-18,7,7,-27,-27,-27,-20,-7,0,42,-28,-12,-27; MA /M: SY='H'; M=-8,-11,-20,-12,-9,-13,-22,22,-5,-13,-4,2,-7,-21,-1,-8,-4,-3,0,-29,0,-7; MA /I: I=-6; MI=-32; MD=-32; IM=-32; MA /M: SY='N'; M=-6,19,-20,10,2,-20,10,1,-22,0,-24,-16,30,-15,-2,-2,4,-5,-25,-28,-18,0; D=-6; MA /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32; MA /M: SY='D'; M=-14,31,-30,44,10,-38,9,-4,-38,-4,-29,-25,13,-12,0,-11,0,-12,-30,-33,-22,5; MA /M: SY='K'; M=-7,0,-27,0,9,-29,-17,-8,-28,37,-29,-11,2,-10,13,22,-1,-5,-19,-23,-12,11; MA /M: SY='F'; M=-15,-30,-21,-36,-26,42,-31,-21,14,-30,28,10,-24,-29,-30,-21,-24,-10,7,-6,14,-26; MA /M: SY='Y'; M=-20,-17,-30,-17,-17,23,-29,31,-4,-10,-3,0,-16,-29,-7,-9,-19,-11,-13,22,72,-17; MA /M: SY='K'; M=-10,1,-30,2,15,-30,-20,-9,-30,46,-29,-11,0,-9,11,27,-9,-10,-21,-21,-11,13; MA /M: SY='G'; M=4,-2,-26,-2,-7,-28,26,-15,-32,-1,-25,-17,0,-15,-9,-3,-1,-13,-22,-22,-22,-9; MA /M: SY='T'; M=-5,1,-21,4,2,-15,-15,-9,-16,-9,-15,-14,-2,-1,-4,-11,8,10,-13,-27,-7,-2; MA /M: SY='P'; M=-9,-18,-36,-10,-1,-28,-20,-20,-19,-10,-28,-19,-18,78,-10,-19,-6,-3,-26,-30,-28,-10; MA /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10; MA /M: SY='T'; M=-5,-7,-20,-11,-6,-16,-20,-1,-5,-4,-12,-3,-3,-15,1,-5,5,7,-2,-28,-7,-4; MA /M: SY='S'; M=-6,2,-23,5,-2,-19,2,6,-26,-5,-25,-16,5,-16,-2,-1,10,-2,-19,-26,-5,-4; MA /M: SY='D'; M=-8,16,-23,19,2,-22,-14,-7,-20,-3,-11,-14,7,-15,-4,-1,-2,-1,-15,-31,-14,-2; MA /I: I=-6; MI=-32; MD=-32; IM=-32; MA /M: SY='H'; M=-7,7,-19,3,4,-13,-11,16,-16,-3,-17,-9,12,-13,6,-2,6,2,-18,-21,1,4; D=-6; MA /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32; MA /M: SY='D'; M=-11,43,-28,59,16,-38,-9,-2,-36,-1,-28,-28,16,-10,-1,-11,1,-9,-26,-38,-20,8; MA /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32; MA /M: SY='N'; M=-4,13,-25,3,1,-16,-7,6,-21,-4,-24,-17,23,-18,-1,-6,-1,-8,-26,-5,-9,0; MA /M: SY='W'; M=-18,-38,-45,-38,-28,10,-22,-28,-14,-22,-9,-14,-38,-30,-20,-20,-38,-27,-24,123,25,-20; MA /M: SY='L'; M=0,-26,-21,-31,-21,2,-27,-21,22,-26,32,18,-24,-24,-17,-22,-21,-8,13,-20,-3,-20; MA /M: SY='A'; M=22,-8,-20,-13,-12,-23,20,-1,-23,-13,-18,-12,-3,-15,-10,-17,3,-10,-15,-22,-17,-12; MA /M: SY='R'; M=-10,-3,-25,-2,12,-24,-15,-1,-27,15,-22,-13,2,-13,16,33,4,-3,-21,-26,-14,11; MA /M: SY='A'; M=38,-7,-10,-14,-7,-20,0,-17,-13,-10,-16,-13,-4,-10,-7,-17,19,6,-3,-26,-20,-7; MA /M: SY='T'; M=-5,10,-17,0,-3,-17,-15,-10,-17,5,-19,-12,15,-12,-3,1,11,25,-12,-30,-12,-3; MA /M: SY='L'; M=-10,-18,-23,-19,-6,-4,-25,-13,5,-7,22,16,-19,-21,-7,-6,-21,-10,0,-21,-4,-6; MA /M: SY='I'; M=-9,-30,-23,-37,-29,12,-36,-28,36,-28,19,15,-23,-24,-25,-26,-19,-8,28,-18,2,-29; MA /M: SY='G'; M=-1,-9,-30,-9,-16,-30,57,-19,-39,-10,-30,-19,0,-19,-16,-13,-1,-19,-29,-20,-27,-16; MA /M: SY='N'; M=-5,17,-24,14,2,-27,3,14,-27,-5,-26,-16,20,-16,3,-6,6,-7,-25,-32,-14,2; MA /M: SY='G'; M=-2,-5,-30,-3,-2,-30,50,-15,-38,-13,-28,-20,0,-15,-11,-15,0,-18,-30,-22,-28,-6; MA /M: SY='G'; M=-1,-13,-29,-13,-20,-24,56,-20,-32,-21,-19,-14,-4,-21,-20,-20,-4,-19,-24,-20,-26,-20; MA /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20; MA /M: SY='G'; M=-7,11,-26,13,-3,-28,21,9,-33,-11,-28,-19,14,-17,-6,-11,5,-10,-27,-31,-17,-5; MA /M: SY='B'; M=-2,10,-22,7,-2,-23,0,-4,-18,-5,-16,-4,8,-15,2,-9,1,-3,-16,-28,-16,0; MA /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30; CC /GENERATED_BY="pfmake -1 -c /home/mllanos/profiles/Bpropeller/Lectine_5/aligns/Lectine_5_w.msf blosum45.cmp"; // |