ID VPS35-REPEATS; MATRIX.
AC AK00230;
DT Fri Jun 29 10:55:14 2007
DE Profile spans 3 repeats (Hierro et al., 2007 Nature 449:1063)
MA /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=131;
MA /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=126;
CC Automatic scaling using small shuffled database;
MA /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=10.1527; R2=0.01843438; TEXT='NScore';
MA /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=-89; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!';
MA /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=-198; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=*; B1=*; E0=*; E1=*; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA /I: B0=0; B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA /M: SY='E'; M=-4,-2,-12,0,1,-21,-13,-13,-13,-4,-12,-6,-7,-16,-3,-9,-3,-4,-4,-29,-16,-1;
MA /M: SY='D'; M=-13,14,-27,22,16,-25,-19,-4,-20,2,-17,-14,2,-11,5,-5,-3,-5,-16,-27,-9,10;
MA /M: SY='R'; M=-11,-13,-23,-17,-11,2,-23,-13,-4,0,1,0,-7,-22,-10,5,-11,-6,-2,-19,-3,-11;
MA /M: SY='I'; M=-6,-20,-23,-23,-18,-1,-28,1,12,-15,7,8,-17,-23,-13,-14,-15,-9,11,-17,10,-18;
MA /M: SY='L'; M=-12,-18,-24,-19,-5,8,-26,-10,2,-9,15,11,-18,-21,-9,-8,-19,-10,-3,-14,6,-7;
MA /M: SY='E'; M=-10,8,-27,11,16,-25,-16,-3,-20,1,-15,-12,6,-4,10,-3,-2,-6,-22,-30,-16,13;
MA /M: SY='L'; M=-9,-16,-9,-23,-19,7,-26,-12,5,-21,8,3,-11,-24,-19,-17,-9,4,5,-23,-1,-19;
MA /M: SY='F'; M=-2,-21,-17,-26,-17,10,-23,-17,5,-15,8,7,-18,-23,-14,-9,-10,-3,8,-16,-1,-15;
MA /M: SY='H'; M=-3,-3,-20,-6,-2,-14,-15,7,-14,-3,-14,-8,2,-16,-1,-1,5,2,-10,-26,-3,-3;
MA /M: SY='Q'; M=-4,-4,-27,-3,12,-28,-19,-6,-18,7,-18,-5,-5,6,18,1,-1,-1,-20,-24,-14,15;
MA /M: SY='M'; M=0,-16,-1,-22,-17,-7,-9,-10,-8,-19,-1,1,-12,-22,-12,-17,-8,-6,-6,-23,-9,-15;
MA /M: SY='F'; M=-8,-17,-21,-25,-20,18,-25,-17,10,-19,9,3,-8,-24,-21,-13,-13,-7,5,-15,3,-20;
MA /M: M=-2,-6,-24,-8,-1,-19,-5,-11,-14,0,-11,-7,-1,-16,0,0,-1,-6,-13,-25,-14,-1;
MA /M: SY='A'; M=8,-11,-20,-14,-8,-10,-19,-16,2,-11,2,-1,-12,-16,-10,-15,-6,-2,3,-20,-5,-10;
MA /M: M=-1,-18,-14,-20,-12,-7,-15,-13,-9,-14,-4,-4,-17,-14,-4,-14,-11,-10,-9,-5,-2,-8;
MA /M: SY='N'; M=-4,-2,-23,-4,-5,-18,-11,-6,-7,-8,-14,-8,2,-10,-7,-8,-1,-5,-6,-29,-14,-8;
MA /M: SY='E'; M=-12,1,-27,4,6,-20,-20,-4,-16,5,-11,-7,-2,-10,6,4,-9,-9,-15,-23,-6,5;
MA /M: SY='E'; M=-5,-7,-12,-8,5,-13,-20,-5,-9,-8,-1,0,-7,-17,4,-9,-6,-7,-12,-23,-6,4;
MA /M: SY='H'; M=-12,-12,-17,-13,-3,-15,-22,6,-10,-5,-5,2,-8,-12,2,5,-10,-9,-12,-26,-7,-3;
MA /I: I=-3; MI=-14; MD=-14; IM=-14;
MA /M: SY='Q'; M=-6,-2,-16,-2,0,-13,-14,2,-5,-2,-6,-1,-3,-11,5,-3,-3,-4,-5,-18,-4,2; D=-3;
MA /I: I=-3; MI=0; MD=-14; IM=0; DM=-14;
MA /M: SY='S'; M=-3,0,-12,0,3,-6,-7,-4,-11,0,-12,-8,3,1,-1,-2,4,0,-10,-14,-7,1; D=-3;
MA /I: I=-3; MI=-14; MD=-14; IM=-14; DM=-14;
MA /M: SY='K'; M=0,-5,-12,-4,2,-11,-8,-7,-8,3,-10,-6,-4,1,-1,2,1,-1,-4,-14,-9,0; D=-3;
MA /I: I=-3; MI=-14; MD=-14; IM=-14; DM=-14;
MA /M: SY='D'; M=-4,11,-15,13,6,-15,-9,-4,-14,-1,-9,-10,6,-9,-1,-1,0,-1,-12,-20,-10,2; D=-3;
MA /I: I=-3; MI=-14; MD=-14; IM=-14; DM=-14;
MA /M: SY='Q'; M=-4,-5,-22,-4,2,-21,-12,-7,-12,0,-10,-5,-5,-15,9,4,-2,-6,-8,-23,-13,5; D=-3;
MA /I: I=-3; MI=-14; IM=-14; DM=-14;
MA /M: SY='M'; M=-2,-13,-23,-15,-5,-16,-16,-15,0,-5,-3,1,-11,-17,-1,-8,-7,-7,0,-24,-11,-4;
MA /M: SY='S'; M=1,-5,-19,-9,-1,-11,-14,-9,-13,-4,-9,-8,0,-16,0,1,5,3,-10,-25,-11,-1;
MA /M: SY='L'; M=4,-24,-19,-28,-19,2,-23,-21,13,-21,18,11,-23,-15,-18,-20,-15,-6,11,-20,-6,-19;
MA /M: SY='V'; M=-6,-16,-21,-19,-12,-7,-17,-15,0,-10,-4,0,-10,-20,-5,-3,-3,-1,2,-23,-8,-10;
MA /M: SY='V'; M=-6,-13,-12,-17,-12,-12,-18,-18,2,-10,-4,-2,-8,-20,-12,-9,-5,-2,4,-28,-12,-13;
MA /M: SY='Y'; M=-5,-14,-23,-14,-4,-3,-22,-8,-4,-10,2,-3,-14,-12,-7,-7,-8,-2,-5,-15,6,-7;
MA /M: SY='L'; M=-11,-28,-11,-31,-24,13,-31,-21,15,-26,19,8,-25,-21,-24,-22,-21,-9,12,-17,4,-24;
MA /M: SY='L'; M=-3,-24,-21,-29,-22,-1,-22,-22,20,-24,22,15,-21,-23,-18,-22,-16,-5,14,-21,-5,-21;
MA /M: SY='H'; M=-9,7,-24,5,5,-24,-9,11,-22,2,-22,-11,10,-15,8,3,2,-4,-20,-29,-11,5;
MA /M: M=-9,-10,-2,-15,-14,-5,-14,-13,-11,-13,0,-5,-3,-25,-13,-3,-7,-3,-9,-27,-11,-14;
MA /M: SY='F'; M=1,-23,-18,-29,-21,19,-24,-18,8,-22,16,5,-20,-24,-22,-19,-13,-3,8,-11,7,-21;
MA /M: SY='M'; M=-3,-19,-26,-21,-9,-10,-22,-17,1,-6,1,2,-17,-11,-8,-4,-14,-9,-1,-9,-7,-10;
MA /M: SY='Q'; M=-6,-3,-24,-5,-2,-14,-17,-2,-12,1,-12,-6,-1,-17,5,5,-1,-4,-13,-18,1,0;
MA /M: SY='F'; M=-5,-17,-13,-20,-12,2,-16,-14,-4,-16,-3,0,-14,-14,-11,-16,-8,-7,-4,-17,-2,-12;
MA /M: SY='Y'; M=-7,-8,-23,-9,-10,-4,-13,-7,-11,-3,-7,-6,-5,-21,-9,2,-7,-6,-8,-16,3,-10;
MA /I: I=-2; MI=-12; MD=-12; IM=-12;
MA /M: SY='P'; M=-6,1,-16,2,8,-25,-16,-1,-21,-5,-21,-15,-1,15,2,-10,-1,-4,-22,-29,-17,3; D=-2;
MA /I: I=-2; MI=-12; MD=-12; IM=-12; DM=-12;
MA /M: SY='D'; M=-11,1,-21,2,0,-3,-19,-10,-11,-3,-6,-8,-2,-14,-7,-2,-5,0,-8,-19,-4,-4; D=-2;
MA /I: I=-2; MI=-12; MD=-12; IM=-12; DM=-12;
MA /M: SY='E'; M=-9,1,-24,5,16,-19,-11,-2,-18,3,-15,-11,0,-10,8,4,-1,-7,-17,-20,-8,10; D=-2;
MA /I: I=-2; MI=-12; MD=-12; IM=-12; DM=-12;
MA /M: SY='N'; M=-7,1,-17,-1,-8,-5,-1,-6,-10,-4,-11,-7,3,-16,-10,-6,-4,-6,-6,-15,-3,-9; D=-2;
MA /I: I=-2; MI=-12; MD=-12; IM=-12; DM=-12;
MA /M: SY='D'; M=-6,11,-17,13,8,-19,-2,-4,-17,1,-17,-13,10,-10,0,-3,3,-4,-14,-24,-14,4; D=-2;
MA /I: I=-2; MI=-12; MD=-12; IM=-12; DM=-12;
MA /M: SY='P'; M=-3,-1,-20,-4,0,-14,-5,-4,-10,-5,-13,-8,2,3,0,-8,-2,-6,-14,-16,-8,-2; D=-2;
MA /I: I=-2; MI=-12; MD=-12; IM=-12; DM=-12;
MA /M: SY='B'; M=-5,2,-13,2,0,-10,-4,1,-9,-6,-6,-5,2,-10,-4,-6,-2,-2,-7,-17,-7,-2; D=-2;
MA /I: I=-2; MI=0; MD=-12; IM=0; DM=-12;
MA /M: SY='E'; M=-4,-2,-12,0,1,-21,-13,-13,-13,-4,-12,-6,-7,-16,-3,-9,-3,-4,-4,-29,-16,-1;
MA /M: SY='D'; M=-13,14,-27,22,16,-25,-19,-4,-20,2,-17,-14,2,-11,5,-5,-3,-5,-16,-27,-9,10;
MA /M: SY='R'; M=-11,-13,-23,-17,-11,2,-23,-13,-4,0,1,0,-7,-22,-10,5,-11,-6,-2,-19,-3,-11;
MA /M: SY='I'; M=-6,-20,-23,-23,-18,-1,-28,1,12,-15,7,8,-17,-23,-13,-14,-15,-9,11,-17,10,-18;
MA /M: SY='L'; M=-12,-18,-24,-19,-5,8,-26,-10,2,-9,15,11,-18,-21,-9,-8,-19,-10,-3,-14,6,-7;
MA /M: SY='E'; M=-10,8,-27,11,16,-25,-16,-3,-20,1,-15,-12,6,-4,10,-3,-2,-6,-22,-30,-16,13;
MA /M: SY='L'; M=-9,-16,-9,-23,-19,7,-26,-12,5,-21,8,3,-11,-24,-19,-17,-9,4,5,-23,-1,-19;
MA /M: SY='F'; M=-2,-21,-17,-26,-17,10,-23,-17,5,-15,8,7,-18,-23,-14,-9,-10,-3,8,-16,-1,-15;
MA /M: SY='H'; M=-3,-3,-20,-6,-2,-14,-15,7,-14,-3,-14,-8,2,-16,-1,-1,5,2,-10,-26,-3,-3;
MA /M: SY='Q'; M=-4,-4,-27,-3,12,-28,-19,-6,-18,7,-18,-5,-5,6,18,1,-1,-1,-20,-24,-14,15;
MA /M: SY='M'; M=0,-16,-1,-22,-17,-7,-9,-10,-8,-19,-1,1,-12,-22,-12,-17,-8,-6,-6,-23,-9,-15;
MA /M: SY='F'; M=-8,-17,-21,-25,-20,18,-25,-17,10,-19,9,3,-8,-24,-21,-13,-13,-7,5,-15,3,-20;
MA /M: M=-2,-6,-24,-8,-1,-19,-5,-11,-14,0,-11,-7,-1,-16,0,0,-1,-6,-13,-25,-14,-1;
MA /M: SY='A'; M=8,-11,-20,-14,-8,-10,-19,-16,2,-11,2,-1,-12,-16,-10,-15,-6,-2,3,-20,-5,-10;
MA /M: M=-1,-18,-14,-20,-12,-7,-15,-13,-9,-14,-4,-4,-17,-14,-4,-14,-11,-10,-9,-5,-2,-8;
MA /M: SY='N'; M=-4,-2,-23,-4,-5,-18,-11,-6,-7,-8,-14,-8,2,-10,-7,-8,-1,-5,-6,-29,-14,-8;
MA /M: SY='E'; M=-12,1,-27,4,6,-20,-20,-4,-16,5,-11,-7,-2,-10,6,4,-9,-9,-15,-23,-6,5;
MA /M: SY='E'; M=-5,-7,-12,-8,5,-13,-20,-5,-9,-8,-1,0,-7,-17,4,-9,-6,-7,-12,-23,-6,4;
MA /M: SY='H'; M=-12,-12,-17,-13,-3,-15,-22,6,-10,-5,-5,2,-8,-12,2,5,-10,-9,-12,-26,-7,-3;
MA /I: I=-3; MI=-14; MD=-14; IM=-14;
MA /M: SY='Q'; M=-6,-2,-16,-2,0,-13,-14,2,-5,-2,-6,-1,-3,-11,5,-3,-3,-4,-5,-18,-4,2; D=-3;
MA /I: I=-3; MI=0; MD=-14; IM=0; DM=-14;
MA /M: SY='S'; M=-3,0,-12,0,3,-6,-7,-4,-11,0,-12,-8,3,1,-1,-2,4,0,-10,-14,-7,1; D=-3;
MA /I: I=-3; MI=-14; MD=-14; IM=-14; DM=-14;
MA /M: SY='K'; M=0,-5,-12,-4,2,-11,-8,-7,-8,3,-10,-6,-4,1,-1,2,1,-1,-4,-14,-9,0; D=-3;
MA /I: I=-3; MI=-14; MD=-14; IM=-14; DM=-14;
MA /M: SY='D'; M=-4,11,-15,13,6,-15,-9,-4,-14,-1,-9,-10,6,-9,-1,-1,0,-1,-12,-20,-10,2; D=-3;
MA /I: I=-3; MI=-14; MD=-14; IM=-14; DM=-14;
MA /M: SY='Q'; M=-4,-5,-22,-4,2,-21,-12,-7,-12,0,-10,-5,-5,-15,9,4,-2,-6,-8,-23,-13,5; D=-3;
MA /I: I=-3; MI=-14; IM=-14; DM=-14;
MA /M: SY='M'; M=-2,-13,-23,-15,-5,-16,-16,-15,0,-5,-3,1,-11,-17,-1,-8,-7,-7,0,-24,-11,-4;
MA /M: SY='S'; M=1,-5,-19,-9,-1,-11,-14,-9,-13,-4,-9,-8,0,-16,0,1,5,3,-10,-25,-11,-1;
MA /M: SY='L'; M=4,-24,-19,-28,-19,2,-23,-21,13,-21,18,11,-23,-15,-18,-20,-15,-6,11,-20,-6,-19;
MA /M: SY='V'; M=-6,-16,-21,-19,-12,-7,-17,-15,0,-10,-4,0,-10,-20,-5,-3,-3,-1,2,-23,-8,-10;
MA /M: SY='V'; M=-6,-13,-12,-17,-12,-12,-18,-18,2,-10,-4,-2,-8,-20,-12,-9,-5,-2,4,-28,-12,-13;
MA /M: SY='Y'; M=-5,-14,-23,-14,-4,-3,-22,-8,-4,-10,2,-3,-14,-12,-7,-7,-8,-2,-5,-15,6,-7;
MA /M: SY='L'; M=-11,-28,-11,-31,-24,13,-31,-21,15,-26,19,8,-25,-21,-24,-22,-21,-9,12,-17,4,-24;
MA /M: SY='L'; M=-3,-24,-21,-29,-22,-1,-22,-22,20,-24,22,15,-21,-23,-18,-22,-16,-5,14,-21,-5,-21;
MA /M: SY='H'; M=-9,7,-24,5,5,-24,-9,11,-22,2,-22,-11,10,-15,8,3,2,-4,-20,-29,-11,5;
MA /M: M=-9,-10,-2,-15,-14,-5,-14,-13,-11,-13,0,-5,-3,-25,-13,-3,-7,-3,-9,-27,-11,-14;
MA /M: SY='F'; M=1,-23,-18,-29,-21,19,-24,-18,8,-22,16,5,-20,-24,-22,-19,-13,-3,8,-11,7,-21;
MA /M: SY='M'; M=-3,-19,-26,-21,-9,-10,-22,-17,1,-6,1,2,-17,-11,-8,-4,-14,-9,-1,-9,-7,-10;
MA /M: SY='Q'; M=-6,-3,-24,-5,-2,-14,-17,-2,-12,1,-12,-6,-1,-17,5,5,-1,-4,-13,-18,1,0;
MA /M: SY='F'; M=-5,-17,-13,-20,-12,2,-16,-14,-4,-16,-3,0,-14,-14,-11,-16,-8,-7,-4,-17,-2,-12;
MA /M: SY='Y'; M=-7,-8,-23,-9,-10,-4,-13,-7,-11,-3,-7,-6,-5,-21,-9,2,-7,-6,-8,-16,3,-10;
MA /I: I=-2; MI=-12; MD=-12; IM=-12;
MA /M: SY='P'; M=-6,1,-16,2,8,-25,-16,-1,-21,-5,-21,-15,-1,15,2,-10,-1,-4,-22,-29,-17,3; D=-2;
MA /I: I=-2; MI=-12; MD=-12; IM=-12; DM=-12;
MA /M: SY='D'; M=-11,1,-21,2,0,-3,-19,-10,-11,-3,-6,-8,-2,-14,-7,-2,-5,0,-8,-19,-4,-4; D=-2;
MA /I: I=-2; MI=-12; MD=-12; IM=-12; DM=-12;
MA /M: SY='E'; M=-9,1,-24,5,16,-19,-11,-2,-18,3,-15,-11,0,-10,8,4,-1,-7,-17,-20,-8,10; D=-2;
MA /I: I=-2; MI=-12; MD=-12; IM=-12; DM=-12;
MA /M: SY='N'; M=-7,1,-17,-1,-8,-5,-1,-6,-10,-4,-11,-7,3,-16,-10,-6,-4,-6,-6,-15,-3,-9; D=-2;
MA /I: I=-2; MI=-12; MD=-12; IM=-12; DM=-12;
MA /M: SY='D'; M=-6,11,-17,13,8,-19,-2,-4,-17,1,-17,-13,10,-10,0,-3,3,-4,-14,-24,-14,4; D=-2;
MA /I: I=-2; MI=-12; MD=-12; IM=-12; DM=-12;
MA /M: SY='P'; M=-3,-1,-20,-4,0,-14,-5,-4,-10,-5,-13,-8,2,3,0,-8,-2,-6,-14,-16,-8,-2; D=-2;
MA /I: I=-2; MI=-12; MD=-12; IM=-12; DM=-12;
MA /M: SY='B'; M=-5,2,-13,2,0,-10,-4,1,-9,-6,-6,-5,2,-10,-4,-6,-2,-2,-7,-17,-7,-2; D=-2;
MA /I: I=-2; MI=0; MD=-12; IM=0; DM=-12;
MA /M: SY='E'; M=-4,-2,-12,0,1,-21,-13,-13,-13,-4,-12,-6,-7,-16,-3,-9,-3,-4,-4,-29,-16,-1;
MA /M: SY='D'; M=-13,14,-27,22,16,-25,-19,-4,-20,2,-17,-14,2,-11,5,-5,-3,-5,-16,-27,-9,10;
MA /M: SY='R'; M=-11,-13,-23,-17,-11,2,-23,-13,-4,0,1,0,-7,-22,-10,5,-11,-6,-2,-19,-3,-11;
MA /M: SY='I'; M=-6,-20,-23,-23,-18,-1,-28,1,12,-15,7,8,-17,-23,-13,-14,-15,-9,11,-17,10,-18;
MA /M: SY='L'; M=-12,-18,-24,-19,-5,8,-26,-10,2,-9,15,11,-18,-21,-9,-8,-19,-10,-3,-14,6,-7;
MA /M: SY='E'; M=-10,8,-27,11,16,-25,-16,-3,-20,1,-15,-12,6,-4,10,-3,-2,-6,-22,-30,-16,13;
MA /M: SY='L'; M=-9,-16,-9,-23,-19,7,-26,-12,5,-21,8,3,-11,-24,-19,-17,-9,4,5,-23,-1,-19;
MA /M: SY='F'; M=-2,-21,-17,-26,-17,10,-23,-17,5,-15,8,7,-18,-23,-14,-9,-10,-3,8,-16,-1,-15;
MA /M: SY='H'; M=-3,-3,-20,-6,-2,-14,-15,7,-14,-3,-14,-8,2,-16,-1,-1,5,2,-10,-26,-3,-3;
MA /M: SY='Q'; M=-4,-4,-27,-3,12,-28,-19,-6,-18,7,-18,-5,-5,6,18,1,-1,-1,-20,-24,-14,15;
MA /M: SY='M'; M=0,-16,-1,-22,-17,-7,-9,-10,-8,-19,-1,1,-12,-22,-12,-17,-8,-6,-6,-23,-9,-15;
MA /M: SY='F'; M=-8,-17,-21,-25,-20,18,-25,-17,10,-19,9,3,-8,-24,-21,-13,-13,-7,5,-15,3,-20;
MA /M: M=-2,-6,-24,-8,-1,-19,-5,-11,-14,0,-11,-7,-1,-16,0,0,-1,-6,-13,-25,-14,-1;
MA /M: SY='A'; M=8,-11,-20,-14,-8,-10,-19,-16,2,-11,2,-1,-12,-16,-10,-15,-6,-2,3,-20,-5,-10;
MA /M: M=-1,-18,-14,-20,-12,-7,-15,-13,-9,-14,-4,-4,-17,-14,-4,-14,-11,-10,-9,-5,-2,-8;
MA /M: SY='N'; M=-4,-2,-23,-4,-5,-18,-11,-6,-7,-8,-14,-8,2,-10,-7,-8,-1,-5,-6,-29,-14,-8;
MA /M: SY='E'; M=-12,1,-27,4,6,-20,-20,-4,-16,5,-11,-7,-2,-10,6,4,-9,-9,-15,-23,-6,5;
MA /M: SY='E'; M=-5,-7,-12,-8,5,-13,-20,-5,-9,-8,-1,0,-7,-17,4,-9,-6,-7,-12,-23,-6,4;
MA /M: SY='H'; M=-12,-12,-17,-13,-3,-15,-22,6,-10,-5,-5,2,-8,-12,2,5,-10,-9,-12,-26,-7,-3;
MA /I: I=-3; MI=-14; MD=-14; IM=-14;
MA /M: SY='Q'; M=-6,-2,-16,-2,0,-13,-14,2,-5,-2,-6,-1,-3,-11,5,-3,-3,-4,-5,-18,-4,2; D=-3;
MA /I: I=-3; MI=0; MD=-14; IM=0; DM=-14;
MA /M: SY='S'; M=-3,0,-12,0,3,-6,-7,-4,-11,0,-12,-8,3,1,-1,-2,4,0,-10,-14,-7,1; D=-3;
MA /I: I=-3; MI=-14; MD=-14; IM=-14; DM=-14;
MA /M: SY='K'; M=0,-5,-12,-4,2,-11,-8,-7,-8,3,-10,-6,-4,1,-1,2,1,-1,-4,-14,-9,0; D=-3;
MA /I: I=-3; MI=-14; MD=-14; IM=-14; DM=-14;
MA /M: SY='D'; M=-4,11,-15,13,6,-15,-9,-4,-14,-1,-9,-10,6,-9,-1,-1,0,-1,-12,-20,-10,2; D=-3;
MA /I: I=-3; MI=-14; MD=-14; IM=-14; DM=-14;
MA /M: SY='Q'; M=-4,-5,-22,-4,2,-21,-12,-7,-12,0,-10,-5,-5,-15,9,4,-2,-6,-8,-23,-13,5; D=-3;
MA /I: I=-3; MI=-14; IM=-14; DM=-14;
MA /M: SY='M'; M=-2,-13,-23,-15,-5,-16,-16,-15,0,-5,-3,1,-11,-17,-1,-8,-7,-7,0,-24,-11,-4;
MA /M: SY='S'; M=1,-5,-19,-9,-1,-11,-14,-9,-13,-4,-9,-8,0,-16,0,1,5,3,-10,-25,-11,-1;
MA /M: SY='L'; M=4,-24,-19,-28,-19,2,-23,-21,13,-21,18,11,-23,-15,-18,-20,-15,-6,11,-20,-6,-19;
MA /M: SY='V'; M=-6,-16,-21,-19,-12,-7,-17,-15,0,-10,-4,0,-10,-20,-5,-3,-3,-1,2,-23,-8,-10;
MA /M: SY='V'; M=-6,-13,-12,-17,-12,-12,-18,-18,2,-10,-4,-2,-8,-20,-12,-9,-5,-2,4,-28,-12,-13;
MA /M: SY='Y'; M=-5,-14,-23,-14,-4,-3,-22,-8,-4,-10,2,-3,-14,-12,-7,-7,-8,-2,-5,-15,6,-7;
MA /M: SY='L'; M=-11,-28,-11,-31,-24,13,-31,-21,15,-26,19,8,-25,-21,-24,-22,-21,-9,12,-17,4,-24;
MA /M: SY='L'; M=-3,-24,-21,-29,-22,-1,-22,-22,20,-24,22,15,-21,-23,-18,-22,-16,-5,14,-21,-5,-21;
MA /M: SY='H'; M=-9,7,-24,5,5,-24,-9,11,-22,2,-22,-11,10,-15,8,3,2,-4,-20,-29,-11,5;
MA /M: M=-9,-10,-2,-15,-14,-5,-14,-13,-11,-13,0,-5,-3,-25,-13,-3,-7,-3,-9,-27,-11,-14;
MA /M: SY='F'; M=1,-23,-18,-29,-21,19,-24,-18,8,-22,16,5,-20,-24,-22,-19,-13,-3,8,-11,7,-21;
MA /M: SY='M'; M=-3,-19,-26,-21,-9,-10,-22,-17,1,-6,1,2,-17,-11,-8,-4,-14,-9,-1,-9,-7,-10;
MA /M: SY='Q'; M=-6,-3,-24,-5,-2,-14,-17,-2,-12,1,-12,-6,-1,-17,5,5,-1,-4,-13,-18,1,0;
MA /M: SY='F'; M=-5,-17,-13,-20,-12,2,-16,-14,-4,-16,-3,0,-14,-14,-11,-16,-8,-7,-4,-17,-2,-12;
MA /M: SY='Y'; M=-7,-8,-23,-9,-10,-4,-13,-7,-11,-3,-7,-6,-5,-21,-9,2,-7,-6,-8,-16,3,-10;
MA /I: E0=0; E1=0; IE=-105; DE=-105;
CC /GENERATED_BY="pfmake -1 vps35-3rep.msf blosum45.cmp";
CC /AUTHOR=Kajava Andrey;
//