Details of the profile Ankyrin

Profile
Accession Number AK657
Filename ANK_c.prf
Author
Theme Ankyrin
Category Repeats
Validated Yes
Description
Full profile
ID   Ankyrin; MATRIX.
AC   AK657;
DT   08/08/2019
DE   Ankyrin repeat Circular
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=33; TOPOLOGY=CIRCULAR;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=30;
CC   Automatic scaling using big reversed database;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.4067; R2=0.00840142; TEXT='NScore';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=725; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=487; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=*; B1=*; E0=*; E1=*; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; B1=0; E0=0; E1=0; BI=-105; BD=-105; IE=-105; DE=-105;
MA   /M: SY='L'; M=0,-19,-17,-22,-15,10,-23,-18,7,-18,11,4,-19,-23,-19,-17,-11,-3,11,-17,0,-17;
MA   /M: SY='E'; M=-6,6,-27,11,17,-28,-6,-6,-27,6,-20,-15,2,-6,7,0,-1,-9,-23,-27,-18,12;
MA   /M: SY='V'; M=6,-18,-6,-23,-18,-7,-20,-16,7,-18,6,5,-16,-22,-15,-18,-4,1,12,-27,-10,-17;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-27,-15,-29,-24,2,-27,-23,23,-22,23,16,-27,-27,-22,-19,-16,-4,27,-25,-6,-23;
MA   /M: SY='K'; M=-7,-4,-26,-2,10,-23,-20,-9,-17,17,-14,-7,-5,-13,8,11,-7,-8,-12,-24,-12,9;
MA   /M: SY='F'; M=-12,-15,-23,-15,-7,6,-25,-7,-2,-12,6,1,-14,-22,-9,-6,-13,-8,-2,-17,3,-8;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-27,-21,-30,-21,11,-28,-18,19,-26,33,16,-24,-26,-19,-20,-22,-8,10,-16,5,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-27,-20,-29,-21,9,-29,-15,18,-26,32,14,-25,-27,-20,-20,-23,-9,13,-18,2,-21;
MA   /I: I=-3; MI=-14; MD=-14; IM=-14;
MA   /M: SY='E'; M=-7,1,-24,4,16,-20,-16,0,-21,7,-15,-11,-1,-11,9,7,-1,-6,-18,-23,-8,12; D=-3;
MA   /I: I=-3; MI=-14; MD=-14; IM=-14; DM=-14;
MA   /M: SY='H'; M=-2,5,-23,2,3,-22,-5,18,-23,-3,-22,-12,11,-8,3,-3,3,-5,-21,-28,-10,1; D=-3;
MA   /I: I=-3; MI=-14; MD=-14; IM=-14; DM=-14;
MA   /M: SY='G'; M=0,-5,-17,-8,-11,-20,29,-13,-25,-10,-20,-13,1,-16,-11,-10,-2,-12,-20,-14,-19,-11; D=-3;
MA   /I: I=-3; MI=0; MD=-14; IM=0; DM=-14;
MA   /M: SY='A'; M=18,-15,-9,-21,-13,-13,-11,-17,-2,-14,0,-1,-13,-18,-9,-15,-2,-4,1,-22,-12,-12;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='D'; M=-14,31,-20,37,13,-29,-9,4,-30,0,-26,-22,22,-13,1,-3,4,-6,-26,-36,-17,7; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-27; IM=-27; DM=-27;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-26,-23,-29,-22,2,-30,-23,21,-21,14,11,-23,-12,-20,-18,-17,-5,18,-22,-5,-23;
MA   /M: SY='N'; M=-11,19,-24,15,4,-17,-8,-3,-16,-5,-17,-14,22,-17,-4,-5,0,-6,-17,-32,-15,-1;
MA   /M: M=-3,-13,-13,-14,-4,-12,-19,-10,-6,-12,-1,-2,-12,-15,-3,-12,-9,-9,-6,-22,-7,-5;
MA   /M: SY='R'; M=-6,-9,-16,-11,-3,-19,-16,-11,-16,6,-13,-6,-6,-9,-2,10,-8,-7,-12,-25,-14,-4;
MA   /M: SY='D'; M=-15,36,-28,50,16,-34,-12,-2,-33,3,-24,-24,15,-11,0,-5,-2,-9,-26,-36,-18,8;
MA   /M: SY='E'; M=-4,-3,-26,-4,6,-17,-15,-5,-18,3,-20,-10,0,5,3,1,0,-5,-19,-23,-10,3;
MA   /I: I=-3; MI=0; MD=-16; IM=0; DM=-16;
MA   /M: SY='B'; M=-10,1,-24,-1,-6,-10,-7,-7,-13,-10,-11,-4,1,-11,-7,-11,-5,-4,-15,-9,-6,-7; D=-3;
MA   /I: I=-3; MI=-16; MD=-16; IM=-16; DM=-16;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-2,-26,-4,-11,-25,43,-14,-31,-13,-25,-17,7,-18,-13,-14,1,-14,-26,-23,-25,-12; D=-3;
MA   /I: I=-3; MI=-16; IM=-16; DM=-16;
MA   /M: SY='R'; M=-7,-1,-26,-4,3,-15,-15,-5,-19,5,-15,-8,2,-16,3,11,-6,-6,-18,-11,-9,2;
MA   /M: SY='T'; M=-2,-4,-13,-12,-11,-9,-20,-18,-5,-11,-5,-6,-1,-13,-10,-8,13,33,0,-29,-10,-11;
MA   /M: SY='P'; M=15,-18,-16,-20,-11,-16,-15,-22,-7,-14,-13,-10,-17,21,-15,-21,-3,-5,-5,-25,-20,-15;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-19,-31,-22,13,-30,-20,20,-28,42,19,-29,-30,-21,-20,-27,-9,13,-19,1,-21;
MA   /M: SY='H'; M=-16,-3,-27,-1,-5,-15,-21,51,-14,-13,-5,7,0,-21,1,-7,-13,-15,-15,-28,8,-5;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-11,-25,-12,-6,-3,-24,-4,0,-12,5,2,-11,-20,-9,-10,-14,-10,-3,-15,1,-8;
MA   /M: SY='A'; M=40,-13,-11,-23,-13,-13,-6,-21,-3,-13,-6,-6,-13,-13,-13,-21,6,-1,6,-20,-16,-13;
MA   /M: SY='A'; M=21,-17,-15,-22,-13,-11,-15,-22,5,-13,2,0,-16,-17,-14,-18,-2,-1,12,-23,-13,-14;
MA   /M: SY='H'; M=-9,-7,-27,-6,5,-18,-16,7,-15,3,-12,-5,-4,-15,3,5,-6,-10,-14,-23,-5,2;
MA   /M: M=-7,-7,-18,-10,-4,-5,-19,-5,-7,-7,-4,-3,-4,-20,-5,-8,-5,-3,-7,-17,0,-5;
MA   /I: I=-4; MI=-21; MD=-21; IM=-21;
MA   /M: SY='G'; M=1,-4,-23,-6,-7,-24,23,-14,-25,-5,-24,-15,3,-16,-9,-6,5,-7,-17,-25,-21,-8; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21;
MA   /M: SY='H'; M=-8,3,-24,3,1,-17,-15,20,-23,1,-19,-10,6,-16,3,4,1,-4,-19,-27,-2,0;
CC   /GENERATED_BY="pfmake -1 -c /home/mllanos/profiles/Ankyrin//aligns/ANK_w.msf blosum45.cmp";
//