Details of the profile TolB_pep B-propeller

Profile
Accession Number AK671
Filename TolB_Prep8_c.prf
Author
Theme Beta-propeller
Category Repeats
Validated Yes
Description
Tol B and Peptidase Bpropellers Circular
Full profile
ID   TolB_pep B-propeller; MATRIX.
AC   AK671;
DT   03/09/2019
DE   Generated from MSF file: '/home/mllanos/profiles/Bpropeller/TolB_Pep8/aligns/TolB_Prep8_w.msf'.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=45; TOPOLOGY=CIRCULAR;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=41;
CC   Automatic scaling using reversed database
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.0265; R2=0.01189753; TEXT='NScore';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=544; N_SCORE=8.5; MODE=1;
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=376; N_SCORE=6.5; MODE=1;
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=*; B1=*; E0=*; E1=*; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; B1=0; E0=0; E1=0; BI=-105; BD=-105; IE=-105; DE=-105;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
MA   /M: SY='D'; M=-8,27,-25,37,13,-31,-1,-4,-31,0,-25,-22,13,-10,-1,-8,2,-8,-24,-32,-19,6; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-25; MD=-25; IM=-25; DM=-25;
MA   /M: SY='G'; M=0,3,-23,2,-9,-25,33,-12,-30,-10,-26,-18,8,-15,-11,-12,7,-7,-23,-25,-23,-10; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-25; IM=-25; DM=-25;
MA   /M: SY='R'; M=-6,-5,-24,-8,-2,-21,-10,-4,-18,7,-15,-7,0,-16,7,11,0,-3,-15,-24,-11,1;
MA   /M: SY='L'; M=-3,-12,-21,-16,-11,-3,-18,-11,-5,-6,1,0,-7,-21,-7,-3,-9,-6,-5,-13,-3,-9;
MA   /M: SY='Y'; M=-12,-23,-22,-27,-21,19,-29,-10,12,-21,18,9,-21,-26,-18,-17,-17,-3,6,-5,22,-21;
MA   /M: SY='F'; M=4,-23,-17,-29,-22,15,-23,-21,10,-22,14,5,-21,-23,-22,-20,-12,-4,12,-13,3,-22;
MA   /M: SY='Y'; M=-12,-22,-27,-26,-16,18,-25,-11,-1,-16,3,1,-19,-24,-12,-11,-17,-11,-6,16,20,-14;
MA   /M: SY='S'; M=1,-5,-14,-7,-2,-19,-10,-12,-14,-4,-18,-12,0,-10,-3,-1,8,4,-7,-31,-17,-3;
MA   /M: SY='S'; M=1,-5,-17,-6,-6,-18,-2,-13,-14,-11,-14,-10,-1,-15,-4,-9,14,9,-7,-31,-16,-5;
MA   /M: SY='S'; M=-5,3,-22,4,7,-18,-8,-8,-19,1,-22,-15,7,-12,0,0,9,0,-16,-30,-15,3;
MA   /I: I=-4; MI=-21; MD=-21; IM=-21;
MA   /M: SY='R'; M=-9,1,-24,2,8,-22,-15,-2,-22,14,-17,-10,2,-13,11,26,-4,-7,-16,-21,-12,8; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=-21; MD=-21; IM=-21; DM=-21;
MA   /M: SY='S'; M=3,2,-13,3,-1,-17,9,-9,-18,-7,-18,-14,4,-9,-4,-9,13,6,-12,-23,-15,-3; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-9,-26,-9,-10,-25,31,-12,-27,-9,-20,-11,-2,-17,-3,-5,-2,-12,-21,-19,-20,-7; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21;
MA   /M: SY='E'; M=-8,-5,-24,-5,9,-12,-17,-2,-18,9,-15,-8,-4,-12,8,9,-5,-8,-16,-11,-5,9; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=-21; MD=-21; IM=-21; DM=-21;
MA   /M: SY='A'; M=1,-8,-12,-10,-3,-12,-13,-10,-9,-9,-7,-6,-5,-7,0,-8,1,-2,-9,-23,-12,-2; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=-21; IM=-21; DM=-21;
MA   /M: SY='H'; M=-6,6,-26,7,9,-26,-16,25,-22,1,-18,-8,5,-14,12,-1,-3,-11,-21,-28,-5,9;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-21,-33,-24,9,-32,-24,28,-28,35,18,-27,-28,-22,-22,-24,-8,21,-20,0,-24;
MA   /M: SY='Y'; M=-12,-17,-21,-21,-20,14,-25,3,0,-13,-4,-1,-15,-28,-13,-13,-16,-10,-6,20,42,-19;
MA   /M: SY='R'; M=-1,-13,-15,-15,-5,-12,-20,-14,-6,-1,-2,-2,-11,-18,-5,1,-6,-5,-2,-24,-10,-5;
MA   /I: I=-6; MI=-32; MD=-32; IM=-32;
MA   /M: SY='Y'; M=-6,-20,-19,-22,-17,2,-26,-9,12,-14,8,7,-19,-23,-9,-13,-12,-4,12,-10,13,-15; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='D'; M=-11,22,-26,29,7,-29,-11,-6,-28,-3,-27,-23,13,5,-2,-7,7,2,-23,-36,-20,1;
MA   /M: SY='L'; M=-2,-21,-19,-25,-15,-1,-26,-21,16,-23,22,9,-19,-21,-15,-19,-12,-1,11,-24,-6,-16;
MA   /M: SY='B'; M=3,10,-21,10,8,-26,-7,-9,-23,4,-21,-16,6,-10,2,-4,6,3,-17,-28,-17,5;
MA   /I: I=-6; MI=-32; MD=-32; IM=-32;
MA   /M: SY='G'; M=0,-1,-21,-5,-10,-23,30,-14,-28,-11,-25,-17,7,-15,-9,-12,11,1,-20,-26,-22,-10; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-4,-27,-4,-11,-28,46,-15,-36,-12,-29,-20,4,-18,-12,-10,4,-13,-27,-24,-26,-12;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
MA   /M: SY='A'; M=6,-8,-10,-12,-8,-2,-8,-13,-5,-5,-4,-4,-6,-11,-9,-7,2,5,1,-14,-6,-8; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-25; IM=-25; DM=-25;
MA   /M: SY='P'; M=-3,-18,-25,-18,-8,-16,-24,-19,2,-9,-7,-3,-17,11,-8,-11,-8,-4,2,-26,-15,-10;
MA   /M: SY='R'; M=-7,-6,-26,-7,5,-23,-15,-4,-22,13,-16,-8,-2,-15,14,27,-3,-4,-18,-22,-12,7;
MA   /M: SY='R'; M=-6,-9,-23,-10,-3,-18,-20,-9,-12,7,-8,-3,-7,-18,6,18,-6,-3,-6,-23,-10,0;
MA   /I: I=-5; MI=-27; MD=-27; IM=-27;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-29,-18,-30,-23,6,-30,-23,25,-26,34,17,-27,-27,-22,-20,-22,-7,22,-22,-3,-23; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='T'; M=3,-5,-12,-12,-10,-6,-17,-17,-8,-11,-10,-9,-4,-8,-11,-12,14,31,-1,-24,-6,-11; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-27; IM=-27; DM=-27;
MA   /M: SY='H'; M=-8,2,-27,4,3,-23,-12,10,-24,0,-23,-12,2,-10,5,-3,0,-6,-20,-17,-7,3;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-4,-23,-5,6,-12,7,-13,-24,-6,-17,-14,-3,-12,-6,-10,2,-4,-18,-20,-14,1; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='E'; M=-1,1,-21,1,5,-21,-5,-10,-19,-2,-19,-14,2,3,-3,-5,3,1,-15,-26,-18,0; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='G'; M=-6,-11,-26,-11,-14,-10,7,-10,-20,-14,-16,-13,-5,-21,-12,-11,-2,-7,-16,-1,-5,-13;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
MA   /M: SY='Q'; M=-9,-7,-26,-8,0,-15,-8,-2,-14,-7,-11,-1,-3,-4,2,-6,-6,-9,-16,-24,-12,0;
MA   /M: SY='N'; M=-6,3,-22,2,-7,-16,-16,2,-7,-11,-11,-7,5,-11,-9,-12,-3,-5,-5,-32,-11,-9;
MA   /M: SY='H'; M=-7,0,-24,2,2,-19,-13,4,-19,-3,-16,-10,-1,-15,4,-3,0,0,-15,-18,-5,2;
MA   /I: I=-4; MI=-23; MD=-23; IM=-23;
MA   /M: SY='N'; M=-1,7,-21,3,-1,-12,-2,-4,-20,-8,-18,-15,10,-15,-7,-10,3,-1,-18,-18,-11,-3; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=-23; MD=-23; IM=-23; DM=-23;
MA   /M: SY='P'; M=-3,-9,-25,-5,-2,-16,-14,-9,-13,-10,-14,-11,-11,31,-8,-15,-6,-7,-16,-23,-15,-8; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=-23; MD=-23; IM=-23; DM=-23;
MA   /M: M=0,-5,-20,-5,-5,-14,-12,-6,-9,-9,-3,-4,-5,-16,-3,-10,-1,-1,-8,-23,-6,-5; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=-23; MD=-23; IM=-23; DM=-23;
MA   /M: SY='W'; M=-1,-12,-17,-13,-9,-7,-7,-12,-8,-5,-9,-6,-11,-8,-5,-3,-7,-5,-6,15,-2,-7; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=-23; MD=-23; IM=-23; DM=-23;
MA   /M: SY='F'; M=-12,-24,-19,-29,-22,33,-25,-17,9,-22,10,4,-18,-23,-24,-17,-15,-7,7,4,14,-22; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=-23; IM=-23; DM=-23;
MA   /M: SY='S'; M=9,0,-14,2,-2,-18,-6,-12,-14,-12,-13,-13,1,-13,-5,-13,18,8,-8,-33,-17,-4;
CC   /GENERATED_BY="pfmake -1 -c /home/mllanos/profiles/Bpropeller/TolB_Pep8/aligns/TolB_Prep8_w.msf blosum45.cmp";
//