Details of the profile WD40 B-propeller

Profile
Accession Number AK673
Filename WD40_c.prf
Author
Theme Beta-propeller
Category Repeats
Validated Yes
Description
Full profile
ID   WD40 B-propeller; MATRIX.
AC   AK673;
DT   03/09/2019
DE   WD40 B-propeller - Circular 
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=42; TOPOLOGY=CIRCULAR;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=38;
CC   Automatic scaling using reversed database
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.0815; R2=0.01932539; TEXT='NScore';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=332; N_SCORE=8.5; MODE=1;
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=228; N_SCORE=6.5; MODE=1;
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=*; B1=*; E0=*; E1=*; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; B1=0; E0=0; E1=0; BI=-105; BD=-105; IE=-105; DE=-105;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-30,-13,-31,-28,2,-31,-28,30,-22,17,12,-29,-29,-28,-21,-14,-2,42,-28,-8,-28;
MA   /M: SY='S'; M=-4,-6,-10,-11,-8,-1,-15,-9,-18,1,-18,-11,0,-19,-8,1,2,-2,-12,-19,-1,-8;
MA   /M: SY='C'; M=4,2,16,0,-7,-22,-12,-7,-24,-13,-21,-17,0,-18,-9,-16,10,4,-12,-37,-18,-8;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-29,-13,-34,-26,2,-34,-26,31,-29,26,16,-25,-26,-22,-25,-21,-9,23,-24,-4,-26;
MA   /M: SY='A'; M=11,-3,-6,-7,-1,-23,-3,-4,-23,-1,-21,-13,1,-15,-4,-7,3,-6,-15,-28,-17,-3;
MA   /M: SY='F'; M=-15,-28,-22,-32,-24,34,-28,-10,5,-27,19,6,-23,-29,-26,-18,-23,-12,3,2,15,-23;
MA   /M: SY='S'; M=-2,1,-18,-2,-1,-19,-11,4,-13,-8,-17,-9,9,-16,7,-6,13,4,-12,-33,-12,3;
MA   /I: I=-5; MI=-27; MD=-27; IM=-27;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-3,-27,4,2,-23,-16,-13,-18,-4,-19,-15,-7,30,-6,-11,-3,-1,-19,-28,-19,-4; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27;
MA   /M: SY='D'; M=-13,26,-25,28,11,-29,-10,3,-27,9,-25,-17,22,-13,11,7,1,-7,-26,-30,-15,10; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-2,-18,-4,-8,-15,18,0,-19,-12,-14,-9,5,-15,-8,-10,3,-6,-16,-21,-13,-8; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-27; IM=-27; DM=-27;
MA   /M: SY='G'; M=-6,-1,-25,-4,-2,-22,4,-13,-22,0,-19,-13,4,-5,-6,-5,0,0,-19,-26,-18,-5;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-18,-22,-18,-16,2,-23,-9,1,-16,10,2,-18,-25,-16,-10,-17,-10,3,-10,0,-16;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-30,-20,-33,-26,11,-32,-25,28,-27,29,16,-27,-28,-24,-22,-21,-7,25,-20,0,-26;
MA   /M: SY='V'; M=10,-23,-7,-28,-23,-5,-21,-22,7,-18,-2,-2,-21,-23,-19,-22,-9,-6,11,-4,-2,-22;
MA   /M: SY='T'; M=2,-5,-14,-9,-8,-10,-14,-13,-8,-12,-15,-11,1,-13,-6,-12,21,25,-3,-28,-5,-8;
MA   /M: SY='G'; M=14,-13,3,-19,-18,-22,15,-22,-19,-19,-17,-13,-8,-19,-17,-22,2,-8,-10,-27,-23,-18;
MA   /M: SY='S'; M=5,-3,-15,-5,-7,-21,15,-15,-23,-13,-26,-18,5,-13,-7,-13,25,15,-13,-33,-21,-7;
MA   /M: SY='G'; M=-4,4,-27,6,2,-18,12,-11,-29,-9,-23,-19,4,-15,-7,-13,1,-10,-24,-13,-16,-2;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29;
MA   /M: SY='D'; M=-14,31,-27,44,12,-34,-3,-4,-35,6,-27,-23,13,-10,0,-4,-2,-10,-26,-31,-17,6; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='G'; M=-5,1,-24,-2,-1,-24,8,-11,-28,6,-25,-15,7,-14,-3,5,5,1,-20,-26,-18,-2;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-15,-19,-19,-14,-4,-23,-8,6,-20,11,4,-11,-19,-11,-16,-3,8,4,-27,-4,-14;
MA   /M: SY='I'; M=2,-27,-22,-33,-25,-2,-30,-27,32,-25,18,13,-22,-22,-20,-25,-15,-7,25,-22,-5,-25;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-5,-27,-4,7,-21,-19,4,-24,21,-17,-8,-1,-15,7,29,-7,-8,-18,-24,-8,5;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-29,-9,-34,-27,1,-34,-27,30,-27,22,14,-25,-27,-23,-25,-19,-7,26,-25,-5,-27;
MA   /M: SY='W'; M=-16,-36,-37,-38,-29,20,-25,-27,-2,-24,-2,-6,-33,-29,-24,-21,-31,-20,-9,79,21,-23;
MA   /M: SY='D'; M=-7,23,-22,29,7,-29,-3,-6,-29,-1,-28,-22,16,-12,-2,-7,13,4,-21,-36,-19,2;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-12,-17,-14,-8,-10,-21,-9,-1,-9,1,-1,-11,-18,-10,-10,-2,5,6,-28,-8,-9;
MA   /I: I=-5; MI=-25; MD=-25; IM=-25;
MA   /M: SY='S'; M=1,-4,-17,-4,3,-15,-12,4,-12,-2,-15,-7,-2,-12,4,-4,7,0,-8,-21,-3,3; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-25; MD=-25; IM=-25; DM=-25;
MA   /M: SY='T'; M=0,7,-11,1,-4,-15,-11,-12,-15,-8,-17,-14,9,-10,-5,-8,21,30,-7,-32,-13,-4; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
MA   /M: SY='G'; M=-5,-11,-31,-10,-14,-28,45,-16,-36,-10,-28,-18,-2,-9,-13,-3,-3,-17,-28,-21,-26,-15;
MA   /M: SY='K'; M=-8,1,-25,2,3,-24,-16,-1,-22,17,-24,-11,3,-13,4,13,3,-3,-15,-28,-10,2;
MA   /M: SY='C'; M=-11,-23,12,-27,-20,7,-28,-22,-3,-16,10,1,-21,-29,-21,-14,-19,-9,2,-23,-5,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-3,-23,-23,-27,-15,-4,-29,-22,21,-18,19,11,-20,-21,-14,-18,-17,-8,14,-21,-5,-17;
MA   /M: SY='K'; M=-7,-7,-28,-8,0,-19,-11,-2,-23,18,-20,-8,-4,-16,10,18,-7,-10,-19,-12,2,4;
MA   /M: SY='T'; M=-5,1,-17,-6,-3,-15,-19,-11,-8,-3,-12,-8,4,-16,-2,0,7,17,-2,-30,-12,-3;
MA   /M: SY='L'; M=-13,-26,-24,-31,-21,17,-32,-18,18,-21,24,12,-22,-26,-20,-17,-23,-10,9,-11,11,-21;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-5,-22,-7,2,-16,-18,-7,-18,4,-16,-10,-4,-6,3,7,4,10,-13,-21,-5,1;
MA   /M: SY='G'; M=-1,0,-25,-2,-7,-23,14,-11,-26,-1,-19,-14,4,-18,-7,2,-3,-11,-20,-24,-19,-8;
MA   /M: SY='H'; M=-16,-14,-28,-16,-14,11,-9,29,-19,-17,-12,-5,-6,-14,-13,-12,-12,-15,-20,-11,16,-15;
MA   /M: SY='N'; M=0,8,-5,5,1,-24,-2,-10,-25,-4,-25,-19,11,-15,-4,-9,11,3,-18,-34,-20,-2;
MA   /M: SY='E'; M=-5,5,-24,3,8,-18,-16,-3,-13,0,-13,-9,6,-14,5,-4,-1,-5,-15,-24,-7,6;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='S'; M=-1,-3,-19,-5,-5,-9,-3,-8,-19,-6,-24,-16,5,-7,-6,-8,16,5,-15,-26,-8,-6;
CC   /GENERATED_BY="pfmake -1 -c /home/mllanos/profiles/Bpropeller/WD40_7/aligns/WD40_edited_12rep_w.msf blosum45.cmp";
//